找回密码
 会员注册
查看: 33|回复: 0

R语言:将R语言中的Seurat数据对象转换为Python能处理的h5ad格式

[复制链接]

2万

主题

0

回帖

6万

积分

超级版主

积分
69864
发表于 2024-9-10 09:30:56 | 显示全部楼层 |阅读模式
背景在基因组学数据分析场景下,有些数据被保存为了R语言中的Seurat对象格式,我们的需求是将Seurat对象格式的数据转换为Python能处理的h5ad格式。R处理代码###1.准备工作#1.1readr包安装install.packages("readr")#1.2Seurat包安装#略#1.3SeuratDisk包安装remotes::install_github("mojaveazure/seurat-disk")###2.导入R包library(readr)library(Seurat)library(SeuratDisk)###3.Seurat数据读取#3.1指定要读取的.RDS文件路径filepath
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 会员注册

本版积分规则

QQ|手机版|心飞设计-版权所有:微度网络信息技术服务中心 ( 鲁ICP备17032091号-12 )|网站地图

GMT+8, 2025-1-7 06:05 , Processed in 0.763711 second(s), 26 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2025 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表